Soto Kudus umumnya menggunakan daging ayam sebagai bahan utamanya. Daging ayam direbus hingga empuk bersama dengan bumbu-bumbu tradisional. Kaldu ayam yang dibuat dengan metode simmering ini bentuknya masih berupa cairan kuah kaldu ayam. Sebaliknya, kaldu ayam instan umumnya berbentuk bubuk karen